El cambio climático, como uno de los factores del cambio global, se expone con dureza en nuestras latitudes, según todos los estudios y modelos. La alteración de los regímenes de lluvias se reflejarán con especial relevancia en ecosistemas prioritarios como las lagunas temporales (Hábitat 3170) y su biodiversidad asociada, entre la que destacan anfibios por su obligada fase larvaria acuática, que principalmente desarrollan en hábitats temporales.

Las charcas generadas y el resto de estructuras de refugio y las limitaciones al uso público hacen del espacio de Refugio Alamillo una zona idónea para el asentamiento de anfibios y reptiles.